大鼠骨髓基质细胞分化为施万细胞样细胞过程中的基因表达变化

• 作者: 陈娇 张丹丹 李军平 牛建国 何仲义 贾桦
• 来源期刊: 神经解剖学杂志
• 关键词: 骨髓基质细胞 施万细胞样细胞 分化 转录组测序 大鼠
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 原著|Original Articles
• 页码范围: 315-322
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16557/j.cnki.1000-7547.2021.03.011

摘要

目的:利用转录组测序技术(RNA-seq)检测骨髓基质细胞(BMSCs)分化为施万细胞(SCs)样细胞过程中基因表达谱的变化,筛选与分化相关的差异表达基因,并分析与分化相关的信号通路.方法:体外培养大鼠BMSCs,用三步诱导法对其进行诱导,在复合生长因子诱导第12 h和7 d收集样本.经Illumina测序平台对BMSCs、诱导培养基(DM)诱导12 h(DM-12 h)和7 d(DM-7 d)的细胞进行生物信息分析,采用ClusterProfiler软件对差异基因集进行GO功能和KEGG代谢通路富集分析.结果:与BMSCs组相比,DM-12 h组有578个基因表达上调,632个基因表达下调;与DM-12 h组相比,DM-7 d组有1165个基因表达上调,872个基因表达下调;与BMSCs组相比,DM-7 d组有629个基因表达上调,529个基因表达下调.经Venn分析,共筛选出140个在各阶段共同表达的差异基因,其中与分化相关的基因主要富集在细胞周期、DNA复制和p53信号通路;并确定Cc-ne2、Mcm3 和 Rrm2可作为下一步研究的候选基因.结论:本研究首次基于转录组测序构建BMSCs诱导分化为SCs样细胞的基因表达谱,揭示分化过程中的差异基因,并筛选出Ccne2、Mcm3和Rrm2作为研究目的基因,为阐明BMSCs分化为SCs样细胞的机制提供依据.