共表达网络鉴定食管鳞癌与腺癌关键差异表达分子

• 作者: 李孟祥 刘轲 阮豪杰 高社干 齐义军 冯笑山
• 来源期刊: 暨南大学学报（自然科学与医学版）
• 关键词: 基因共表达网络 食管鳞癌 食管腺癌 数据挖掘
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 页码范围: 138-145
• 页数: 8页
• 分类号: R735.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11778/j.jdxb.2021.02.004

摘要

目的:探究食管鳞癌与食管腺癌关键差异表达分子,为临床个体化治疗和靶向治疗提供依据.方法:应用食管鳞癌和食管腺癌的mRNA转录组数据确定其差异表达基因;根据无标度网络理论及差异表达基因构建加权基因共表达网络;通过相关性分析确定与食管腺、鳞癌分组特征相关性最强的网络模块及模块内节点基因.结果:通过共表达网络构建出19个基因模块,其中Blue和Turquoise模块与食管腺癌、鳞癌相关性最强,相关系数分别为-0.95和0.89;EPS8L3和SOX15分别为Blue和Turquoise模块的代表性节点基因;在TCGA食管癌数据集、GSE26886数据集、癌细胞数据库中,EPS8L3和SOX15基因是食管腺癌和食管鳞癌的关键差异基因,能够鉴别诊断食管鳞癌和食管腺癌.结论:EPS8L3和SOX15可作为食管腺癌和鳞癌关键差异表达分子,为食管癌精准治疗提供理论基础.