短小芽孢杆菌非编码RNA Bpsr145的鉴定及初步探究

• 作者: 宋婷 徐云帆 贺婷停 覃佳 黄宇 王海燕
• 来源期刊: 西南农业学报
• 关键词: 短小芽孢杆菌 小非编码RNA Northern blotting 基因敲除
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 耕作栽培·生理生化|TILLAGE & CULTIVATION·PHYSIOLOGY
• 页码范围: 52-57
• 页数: 6页
• 分类号: Q74
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2021.1.007

摘要

[目的]基于前期对短小芽孢杆菌SCU11的转录组测序结果,对在转录组数据中不同阶段的表达量存在较明显差异的候选sRNA Bpsr145进行鉴定及探究.[方法]通过Northern blotting和独立转录验证Bpsr145的表达,使用不同的程序对其序列保守性、二级结构以及靶标基因进行分析,另外利用电转化方法构建一个Bpsr145敲除突变体.[结果]证实Bpsr145是一个真实存在并独立转录的sRNA,且在不同的培养基中显示不同的表达谱,但Bpsr145敲除菌株和野生型菌株在生长情况和蛋白质谱中不存在显著差异.[结论]本研究鉴定了一个短小芽孢杆菌的sRNA,丰富了芽孢杆菌非编码RNA数据库,为研究非编码RNA介导的转录后调控提供了新的材料.