围产期奶山羊注射5-HTP后血液ceRNA网络构建分析

• 作者: 胡凯召 赵海瑛 陈顺新 杜玮 高慧杰 郑惠玲
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 关键词: 围产期 全转录组 竞争性内源性RNA 低血钙症
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 19-24
• 页数: 6页
• 分类号: S826
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1182.2021.02.004

摘要

处于围产期的奶山羊由于血液中钙离子迅速降低极易引发低血钙症,5-羟色胺(5-hydorxytyrptamine,5-HT)可以调节生物体内钙代谢,但具体调节机制尚不明确.该研究通过注射5-羟色氨酸(5-HTP,5-hydroxytryptophan)来增加围产期奶山羊体内的5-HT浓度,采集血液提取RNA后,采用全转录组测序技术筛选鉴定差异表达mRNA、microRNA、LncRNA和CircRNA.通过Metascape对差异表达的基因进行富集分析,发现这些差异表达基因主要参与钙代谢、脂质代谢、免疫反应、细胞凋亡等过程.通过预测转录本之间的结合情况构建LncRNA/CircRNA-microRNA-mRNA的竞争内源性RNA (Competing Endogenous RNA,ceRNA)调控网络,并对网络中的基因进行富集分析发现3个与钙代谢相关的基因,分别是Toll样受体9(Toll Like Receptor 9,TLR9)、缝隙连接蛋白γ2 (Gap Junction Protein Gamma 2,GJC2)和连接素1(Junctophilin1,JPH1),LncRNA MSTRG.1354.2可与TLR9竞争性地结合microRNA NC.030825.1_6027,进而调控TLR9的表达,MSTRG.56601.1和MSTRG.101405.3都可以与GJC2、JPH1竞争性地结合NC.030814.1_19917,进而调控GJC2和JPH1的表达.该研究结果为5-HT调控山羊钙代谢提供了一种全新的分子机制.