COL5A2在胃癌组织中的表达及其与患者预后的关系

• 作者: 徐珊 张雪琳 田字彬
• 来源期刊: 精准医学杂志
• 关键词: 胃肿瘤 细胞系 肿瘤 胶原Ⅴ型 数据库 遗传学 数据库挖掘 基因表达 突变 细胞增殖 预后 生物标记
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 6-13
• 页数: 8页
• 分类号: R735.2|R394
• 语种: 中文
• DOI: 10.13362/j.jpmed.202101002

摘要

目的 探讨Ⅴ型胶原蛋白α2(COL5A2)基因在胃癌(GC)组织中的表达及与患者预后的关系.方法使用Oncomine数据库分析COL5A2基因在GC组织的表达;通过cBioPortal数据库探寻COL5A2基因突变情况;利用Kaplan-Meier Plotter平台绘制COL5A2 mRNA表达水平与GC患者预后的生存曲线;使用GEPIA数据库对COL5A2基因在GC中的表达及临床预后关系进行验证;采用GeneMANIA数据库分析COL5A2基因-基因互作网络,并进行功能富集分析.通过实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)技术检测4种GC细胞株(HGC-27、MKN-45、BGC-823和SGC-7901)COL5A2 mRNA的表达水平;用小干扰RNA(siRNA)抑制HGC-27细胞COL5A2基因的表达,将细胞分为转染NC si-RNA的阴性对照组(si-NC组)和转染COL5A2 siRNA的转染组(si-1、si-2和si-3组),最后通过CCK-8和细胞克隆实验检测COL5A2基因下调对GC细胞增殖的影响.结果数据库分析显示COL5A2基因在GC组织中高表达,且与GC患者的肿瘤分期呈正相关;cBioPortal数据库研究发现COL5A2基因在GC中的突变率为10.36％,并且COL5A2基因突变组比非突变组总生存期更长;生存曲线分析表明高COL5A2 mRNA表达与GC患者较差的临床预后显著相关;此外,通过GeneMANIA数据库探索发现COL5A2基因与COL5A1、BMP1、ITGA1等20种基因互作调控,主要与细胞外基质受体交互、骨骼系统开发以及肽交联等有关.qRT-PCR检测结果显示,COL5A2 mRNA在HGC-27和MKN-45细胞株中显著高表达;HGC-27细胞经过下调COL5A2基因表达后,与si-NC组相比,si-1和si-2组的细胞增殖能力以及克隆形成能力均明显下降.结论COL5A2基因在GC组织和细胞中高表达,与患者的肿瘤分期和不良预后密切相关,COL5A2基因突变患者预后较好,且COL5A2基因与细胞外基质受体交互、骨骼系统开发、肽交联等有关,下调COL5A2基因的表达可抑制GC细胞的增殖和克隆形成能力,因此COL5A2基因有望成为治疗GC的潜在新靶点.