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月季插穗不定根起始的转录组分析和关键基因筛选
月季插穗不定根起始的转录组分析和关键基因筛选
作者:
陈静
陈芸
热依麦阿依·阿布都艾尼
方志刚
凯迪日耶·玉苏普
马刘峰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
月季
扦插
不定根
转录组
摘要:
为研究月季插穗在不定根发生过程中的关键基因调控机理,利用Illumina平台测序技术对切花月季品种'卡罗拉'插穗的3个发育阶段(不定根未启动期、愈伤组织形成期和不定根伸长期)插穗基部1 cm皮层进行转录组测序分析,结果表明:月季插穗不定根发生的3个阶段中,在不定根未启动期与愈伤组织形成期之间共筛选出差异表达基因5033个,其中2313个基因上调,2720个基因下调;在愈伤组织形成期与不定根伸长期之间共筛选出差异表达基因1865个,其中1332个基因上调,533个基因下调;GO功能分析表明,差异表达基因主要参与生物过程、分子功能和细胞组分3大功能;KEGG富集分析结果表明,差异表达基因主要参与植物激素信号转导、次生代谢产物的合成以及碳水化合物的合成等代谢通路;将月季插穗生根过程中差异性最为显著的8个基因通过实时荧光定量PCR检测其转录水平变化,结果表明:实时荧光定量PCR的验证结果与转录组测序结果基本一致.
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文献信息
篇名
月季插穗不定根起始的转录组分析和关键基因筛选
来源期刊
华南师范大学学报(自然科学版)
学科
关键词
月季
扦插
不定根
转录组
年,卷(期)
2021,(3)
所属期刊栏目
生物学与生物工程|Biology & Bioengineering
研究方向
页码范围
54-63
页数
10页
分类号
Q943.2|Q786
字数
语种
中文
DOI
10.6054/j.jscnun.2021044
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不定根
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
华南师范大学学报(自然科学版)
主办单位:
华南师范大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-5463
CN:
44-1138/N
开本:
16开
出版地:
广州市石牌华南师范大学
邮发代号:
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
2704
总下载数(次)
9
总被引数(次)
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