高温胁迫下尼罗罗非鱼肝脏组织的转录组分析

• 作者: 魏亚丽 周艳 黄思婕 鲁纪刚 陈良标
• 来源期刊: 大连海洋大学学报
• 关键词: 尼罗罗非鱼 高温胁迫 转录组 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Articles
• 页码范围: 222-228
• 页数: 7页
• 分类号: S965.125
• 语种: 中文
• DOI: 10.16535/j.cnki.dlhyxb.2020-099

摘要

为探究罗非鱼高温胁迫响应的调控作用机理,选用孵化12 d后的尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus幼鱼,基于RNA-seq技术对尼罗罗非鱼高温处理组(36℃高温胁迫下养殖30、50、70 d)和常温对照组(28℃,30、50、70 d)肝脏组织样品进行转录组分析.结果表明:高温处理组与常温对照组共获得39.23 Gb clean data;28℃-30 d与36℃-30 d文库比较发现,存在4342个差异基因,28℃-50 d与36℃-50 d文库比较发现,存在3139个差异基因,28℃-70 d与36℃-70 d文库比较发现,存在3042个差异基因;进一步将差异表达基因进行GO功能注释和KEGG富集分析,发现差异基因主要富集在糖酵解/糖异生、细胞周期、内质网的蛋白质加工及胰岛素信号等通路上;通过RT-qPCR试验对mTOR信号通路及相关通路中的8个差异基因进行验证,证实了转录组测序结果的可靠性.研究表明,高温胁迫下尼罗罗非鱼肝脏组织中参与热应激相关的基因涉及生长、蛋白质折叠及能量代谢等多个生物学过程,本研究结果为深入研究罗非鱼高温胁迫响应调控机制奠定了基础.