2012-2019年中国未知HAdV病毒株分型及基因特征分析

• 作者: 马骁 刘万红
• 来源期刊: 肿瘤防治研究
• 关键词: 人腺病毒 系统进化分析 溶瘤腺病毒 分型 癌症
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究|BASIC RESEARCH
• 页码范围: 581-585
• 页数: 5页
• 分类号: R732
• 语种: 中文
• DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2021.20.1416

摘要

目的 分析11株来自中国尚未明确分型的HAdV病毒株完整基因组的基因特征并分型.方法 从GenBank数据库中下载到67条已明确基因型的HAdV基因组序列和7条HAdV参照基因组序列,将这74条参照序列与11株未明确分型的HAdV病毒株基因组序列进行基因结构、基因同源性以及系统进化等分析,从而确定其分型.结果 从系统进化分析结果预测出6株HAdV可能的分型,再由多序列比对分析进行验证.其中两株HAdV通过多序列比对结果发现与HAdV-B参照基因组序列之间的同源性为97.8％,属于B型HAdV;两株HAdV与HAdV-D参照基因组序列之间的同源性为92.8％,属于D型HAdV;还有两株HAdV的多序列比对结果与系统进化分析预测结果不一致,无法推断其分型.剩余5株未能预测的HAdV通过与7条HAdV参照序列进行多序列比对分析,发现与B型HAdV基因组序列的同源性达到了97.9％,推测这5株HAdV基因组可能属于B型HAdV.结论 从基因角度来对11株未知的HAdV基因组进行分型,预测有7株可能属于B型HAdV,有两株可能属于D型HAdV,还有两株无法判断其分型.其中7株B型HAdV可能适合作为溶瘤腺病毒进行骨肉瘤的治疗.