小管福寿螺SNP标记开发及其在物种鉴定中的应用

• 作者: 林英 肖麒 林友福 李雪霞 殷文莉 李宏 陈炼
• 来源期刊: 南京师大学报（自然科学版）
• 关键词: 小管福寿螺 斑点福寿螺 全基因组重测序 单核苷酸多态性位点 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 96-102
• 页数: 7页
• 分类号: K826.15
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4616.2021.03.015

摘要

小管福寿螺(Pomacea canaliculata)是全球100种恶性外来入侵物种之一,对入侵地的经济和环境造成了严重危害.研究发现,入侵中国的福寿螺除小管福寿螺外,还包括斑点福寿螺(P.maculata).本研究基于全基因组重测序数据开发单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)用于福寿螺的遗传多样性分析及物种鉴定.利用Sanger测序法对开发的22个SNP位点在浙江丽水小管福寿螺群体中进行遗传多样性分析,结果表明观测杂合度和期望杂合度范围分别为0～0.933和0.033～0.549,多态信息含量(PIC)范围为0.032～0.466.通过计算上述位点在小管福寿螺和斑点福寿螺之间分化指数(Fst)和等位基因频率,获得在两物种中存在明显差异的5个SNP位点用于物种鉴定.在30个小管福寿螺和18个斑点福寿螺样本中进行分型验证,结果表明,5个SNP位点单独使用时物种鉴定准确率均较高(>84.21％),当联合使用3～5个位点时准确率可达到100％.这些SNP位点将有助于福寿螺种群遗传学方面的研究以及小管福寿螺和斑点福寿螺高效、准确的物种鉴别.