PDGFA在鼻咽癌中的差异表达及其功能分析

• 作者: 唐玉莲 陈启威 韦贵将 李玉颖 候沅林 卢诗丽 刘洁兰 王太重
• 来源期刊: 右江民族医学院学报
• 关键词: PDGFA 鼻咽肿瘤 差异表达 功能分析 基因芯片 调控网络
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著与临床报道
• 页码范围: 46-50
• 页数: 5页
• 分类号: R739.03
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-5817.2021.01.010

摘要

目的 探讨血小板衍生生长因子A(platelet-derived growth factor subunit A,PDGFA)在鼻咽癌中的差异表达和可能的功能作用.方法 利用基因芯片数据库(GEO数据库)中的基因表达谱数据,通过GEO2R在线分析工具分析PDGFA基因在正常鼻咽黏膜组织与鼻咽癌组织中的差异表达情况,并通过STRING数据库和DAVID数据库分析该基因及其相关基因的功能作用,最后通过GCBI在线实验室分析其可能参与的共表达调控网络,并预测其转录调控因子.结果 发现PDGFA基因在正常鼻咽黏膜组织与鼻咽癌组织中具有差异表达.PDGFA基因及其相关基因功能富集分析发现,它们共同参与了12个生物学过程、4个细胞组分、3个分子功能和11个信号通路,并在肿瘤的发生、发展和转移过程中均具有显著的富集作用,如MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路、细胞增殖的正调控、细胞迁移的正调控、黏着、ERK1和ERK2级联的正调节、蛋白质自磷酸化的正调控等.另基因共表达调控网络和转录因子预测发现,PDGFA基因与许多基因、蛋白、转录因子以及microRNA具有相互作用.结论 PDGFA可能通过多种途径,如细胞增殖和迁移的正调控、信号转导、蛋白质自磷酸化以及分子间的相互作用等参与鼻咽癌的发生、发展和迁移.