基于高分辨质谱及分子对接技术研究适配体与倍氯米松的相互作用

• 作者: 樊洪利 刘亚雄 李苏亚 曾文杰 罗卓雅
• 来源期刊: 中国生物化学与分子生物学报
• 关键词: 高分辨傅里叶变换离子回旋共振质谱仪 分子对接 适配体 倍氯米松
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research Papers
• 页码范围: 636-643
• 页数: 8页
• 分类号: Q31
• 语种: 中文
• DOI: 10.13865/j.cnki.cjbmb.2021.03.1034

摘要

倍氯米松(beclomethasone)是一种有效的糖皮质激素,而倍氯米松适配体是对倍氯米松具有亲和力与特异性的单链DNA分子.目前对两者的相互作用仍不清楚,研究适配体与药物的相互作用对适配体的应用具有一定的意义.本研究采用高分辨傅里叶变换离子回旋共振质谱仪(FT-MS)及分子对接软件计算模拟研究适配体与倍氯米松的相互作用.首先,在优化的高分辨质谱条件下,通过电喷雾离子源负离子扫描模式对适配体与倍氯米松复合物进行检测.测得复合物多为-8价离子.在饱和前,适配体与倍氯米松化学结合计量数之比为1∶1,其解离常数Kd值为1.01±0.23μmol/L.经分子对接软件模拟,获得适配体与倍氯米松的化学结合计量数之比为1∶1,两者结合自由能为-24 kcal/mol,主要以氢键作用力相结合.最后,使用超微量紫外检测两者结合前后的吸收波长变化以验证两者的结合,并获得适配体与倍氯米松复合物的解离常数Kd值为1.67±0.35μmol/L,其结果与高分辨FT-MS结果相近.高分辨FT-MS检测与分子对接模拟不仅提供了适配体与倍氯米松的亲和力,也提供了两者的化学结合计量数之比等其它相互作用信息,对深化适配体的应用具有一定的意义.