腹主动脉瘤MTHFR-MMP2基因-基因交互作用研究

• 作者: 王斯悦 秦雪英 隗英琦 左尚维 陈泓伯 王梦莹 吴瑶 吴俊慧 王小文 王紫荆 王伽婷 于欢 武轶群 吴涛 胡永华
• 来源期刊: 第三军医大学学报
• 关键词: 腹主动脉瘤 基因-基因交互作用 匹配病例对照 交互作用指数 相乘模型 相加模型
• 年，卷（期）: 2021,（12）
• 所属期刊栏目: 专题报道:常见慢性非传染性疾病的预防与控制|Monographic Reports
• 页码范围: 1117-1125
• 页数: 9页
• 分类号: R181.3|R394.3|R654.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16016/j.1000-5404.202101018

摘要

目的 探索MTHFR-MMP2基因-基因交互作用是否影响患腹主动脉瘤(abdominal aortic aneurysm,AAA)的风险.方法 基于1:2匹配病例对照研究设计,以2011-2014年解放军总医院血管外科的AAA患者、同期同一医院及北京市房山区两地性别、年龄匹配的非AAA患者为研究对象;采用标准化问卷收集其基本人口学资料、病史及行为危险因素;开展体格检查、腹主动脉超声,并采集5 mL外周静脉血液标本对基因分型.采用传统及机器学习方法,包括条件Logistic回归、广义多因子降维(generalized multifactor dimension reduction,GMDR)、非监督式稀疏因子分析的机器学习方法(EPIstasis sparse factor analysis,EPISFA),分别在相加交互作用、相乘交互作用尺度上,探索MTHFR与MMP2基因-基因交互作用是否影响患腹主动脉瘤风险,并采用交互作用超额危险度(relative excess risk of interaction,RERI)、交互作用归因比(attributable proportion of interaction,API)、交互作用指数(the synergy index,S)3种指标评价MTHFR与MMP2间的基因-基因交互作用的方向和大小.结果 2011-2014年共纳入155组1:2的匹配病例对照(共465人).在调整协变量后,同时在乘法和加法尺度下发现MTHFR基因与MMP2基因上多个位点(rs1 132896,rs1477017,rs1992116,rs243847)可能存在拮抗交互作用(P＜0.05),影响AAA风险,并在3种分析方法中彼此验证;在高维交互作用上,GMDR和EPISFA提示MTHFR-MMP2间可能存在高维交互作用,具有较高的交叉验证一致性,且结果具有统计学差异(P＜0.05).结论 MTHFR-MMP2基因间可能存在拮抗基因-基因交互作用影响患AAA风险.