杨树种质SSR指纹数据库构建

• 作者: 刘超凡 张国君 徐刚标
• 来源期刊: 中南林业科技大学学报
• 关键词: 杨树 TP-M13-SSR 指纹图谱 聚类分析
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 97-104
• 页数: 8页
• 分类号: S792.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.14067/j.cnki.1673-923x.2021.02.012

摘要

[目的]构建林木种质资源指纹数据库是林木种质材料遗传鉴定的前提,也可为林木杂交育种提供清晰的遗传学背景.[方法]选取亲缘关系较远的8份杨树无性系材料筛选SSR引物,基于TP-M13-SSR技术进行SSR-PCR扩增,采用ABI3730XL毛细管电泳系统检测PCR扩增产物,利用GeneMarkerV1.91进行基因分型,Cervus3.0.7估算多态信息含量(PIC)和各位SSR位点无效等位基因频率(pN),POPGENE3.2估算各SSR位点上的等位基因数目(Na)、Shannon信息指数(I)和观测杂合度(HO),NTSYS-pc2.1进行遗传聚类分析.[结果]共筛选出13对条带清晰、重复性好的SSR引物,共扩增出89条多态性条带,单个位点上的等位基因数目为2～12个,平均值为6.5个;Shannon's信息指数(I)为0.13～1.91,平均值为0.97;多态信息指数(PIC)为0.19～0.81,平均值为0.56;观测杂合度为0.06～0.76,平均值为0.40.聚类分析结果表明,参试的无性系种质材料分为3类,第一类为南林系列无性系;第二类为中林108杨、中潜1号、中潜3-2、中驻2号、中驻4号、中驻6号、中驻7号、中驻8号、浙7、中皖1号、中皖2号、丹红杨、A65/27、南抗4、南抗3;第三类为湘林系列无性系.[结论]TP-M13-SSR分子标记技术能有效地鉴别杨树无性系种质,明晰无性系间亲缘关系,遗传聚类的结果与其谱系关系基本一致.研究结果为杨树无性系种质鉴定及进一步开展杨树杂交育种奠定了基础.