2009-2017年柯萨奇病毒A组4型贵州分离株的基因特征分析

• 作者: 王宇 任刚 苏飞 王寅寅 唐小敏
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒A4 进化分析 基因特征
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 实验技术及其应用
• 页码范围: 312-315
• 页数: 4页
• 分类号: R373.23
• 语种: 中文

摘要

目的 分析贵州省柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CVA4)分离株的基因特征.方法 对2009-2017年贵州省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中分离到的19株CVA4,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法进行VP1区扩增并对扩增产物测序,通过MEGA 7.0软件采用邻位相接法(neighbor joining method)构建遗传进化树进行基因特征分析,可靠性通过1 000 Bootstrap值评估.结果 19株CVA4贵州分离株之间的的核苷酸同源性为92.0％～100.0％,氨基酸同源性为96.1％～100.0％,与原型株high point株之间的核苷酸同源性为83.3％～85.7％,氨基酸同源性为95.1％～98.4％;19株CVA4均为C2基因亚型,主要聚集在Cluster1和Cluster 2分支,其中Cluster1是2009年后贵州地区持续传播的优势群体.结论 2009-2017年贵州省AFP病例中CVA4贵州分离株为C2基因亚型.