健康与腹泻林麝肠道菌群的多态性

• 作者: 杜欣颖 夏介英 李东晓 张春梅 周静 竭航
• 来源期刊: 中国微生态学杂志
• 关键词: 林麝 腹泻 16S rRNA 粪便菌群
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 论著|Articles
• 页码范围: 745-751
• 页数: 7页
• 分类号: S811.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.202107001

摘要

目的 分析圈养状态下正常林麝和腹泻林麝粪便菌群的组成差异,找到能够影响肠道总菌群稳态的标志菌,为减少林麝腹泻提供防治新策略.方法 测序分析54只健康林麝(正常组)和18只有腹泻症状的林麝(腹泻组)肠道菌群总DNA中16S rRNA基因V3-V4区,注释微生物种类和数量.计算Chao1、Ace、Shannon和Simpson等多样性指数,进行聚类分析.结果 正常组和腹泻组之间共有的可操作分类单元(OTUs)2 366个,正常组特有的OTUs 409个,腹泻组特有的OTUs 150个.按组计算α多样性指数,结果表明腹泻组Chao1指数(1 352.766±75.497,t=10.798 7,PP＜0.000 1)、Ace指数(1 381.480±75.937,t= 11.037 5,P＜0.000 1)均高于正常组(1 126.655±81.090,1149.175±81.370),Shannon 指数(6.839±0.546,t=1.810 3,P = 0.053 0)、Simpson 指数(0.937±0.041,t =3.644 4,P＜0.000 1)均低正常组(7.097±0.448,0.974±0.025).通过 Wilcoxon 秩和检验,MRPP分析计算比较值A为0.072 4,组间差异大于组内差异(Significance = 0.01),差异有统计学意义.2组门水平上比较,找到5个差异物种,分别为拟杆菌门(Bacteroidetes)、螺旋体门(Spirochaetes)、放线菌门(Actinobacteria)、广古菌门(Euryarchaeota)和黑水仙菌门(Melainabacteria).属分类水平上,找到差异物种23个,其中有代表性的物种为拟杆菌属(Bacteroides)、另枝菌属(Alistipes)、不动杆菌属 (Agathobacter)、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)、根瘤菌属(Rhizobiaceae)和黄金杆菌属(Chryseobacterium).结论 腹泻发生时,林麝的肠道菌群丰富度和多样性有所下降,菌群总量显著增加.拟杆菌门物种丰富度极显著性减少的同时,作为潜在致病菌标志的变形菌门(Proteobacteria)比例上升,Chryseobacterium数量极显著升高,研究结果丰富了对林麝腹泻基于肠道菌群变化的认识.