基于基因表达谱和DNA甲基化谱的银屑病相关致病基因的探索分析

• 作者: 韩凤娴 李宏峰 孙雯雯 赵俊芳 吴亚柳
• 来源期刊: 中国慢性病预防与控制
• 关键词: 银屑病 致病基因 差异表达基因 DNA甲基化
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 499-504,封3
• 页数: 7页
• 分类号: R593
• 语种: 中文
• DOI: 10.16386/j.cjpccd.issn.1004-6194.2021.07.005

摘要

目的 鉴定银屑病相关新的致病基因,初步探索银屑病的分子发病机制.方法 首先使用基因表达数据库(GEO)下载的银屑病芯片数据进行综合分析.然后利用DAVID数据库对差异表达基因(DEGs)进行KEGG通路和Reactome功能富集分析,获得功能注释和潜在的重要通路.采用基因表达谱和DNA甲基化的综合分析筛选关键基因.结果 该研究发现 KYNU、PGBD5、CD22、HSD17B14、BTBD16、ASMT、RRH、SIGLEC16、SPATA17及 NETO1等10个基因可能与银屑病有关.其中CD22、HSD17B14、PGBD5和KYNU与差异甲基化位点有关,可能是银屑病关键的潜在致病基因.功能富集分析表明,KYNU和ASMT主要富集于吲哚衍生物和必需氨基酸代谢过程以及色氨酸代谢途径.结论 银屑病的发生可能与致病基因中某些特定位点的甲基化及体内某些必需氨基酸的代谢相关.