人肝细胞癌细胞DNA甲基化谱的检测及分析

• 作者: 周翔宇 孙宁 张佳林 张城硕 陈保民
• 来源期刊: 中国医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肝细胞癌 甲基化谱 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1111-1116
• 页数: 6页
• 分类号: R735.7
• 字数: 3302字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12007/j.issn.0258-4646.2017.12.012

摘要

目的 检测人肝细胞癌细胞的DNA甲基化谱,明确肝细胞癌细胞中差异甲基化位点和基因的表达分布情况,进一步探讨DNA异常甲基化与肝细胞癌发生发展的关系.方法 使用DNA甲基化芯片(Infinium Human Methylation 450K BeadChip)检测人肝细胞癌细胞Huh7和人永生化肝细胞L02的甲基化谱,并对检测结果进行生物学分析.结果 共检测到差异性甲基化位点102 254个,差异性甲基化基因26 511个,甲基化相关信号通路43个,其中57.3％的高甲基化CpG位点和39.4％的低甲基化CpG位点的甲基化差异程度≥50％,筛选后确定了3 222个显著高甲基化基因和2 204个显著低甲基化基因.结论 在Huh7和L02细胞中存在大量差异性甲基化CpG位点及基因,Huh7细胞中可检测到大量抑癌基因DNA的异常高甲基化,提示DNA异常甲基化与肝细胞癌的发生发展密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张佳林	中国医科大学附属第一医院肝胆外科暨器官移植科	60	155	6.0	9.0
2	孙宁	中国医科大学附属第一医院肝胆外科暨器官移植科	15	19	3.0	3.0
3	张城硕	中国医科大学附属第一医院肝胆外科暨器官移植科	14	13	2.0	3.0
4	陈保民	中国医科大学附属第一医院肝胆外科暨器官移植科	4	2	1.0	1.0
5	周翔宇	中国医科大学附属第一医院肝胆外科暨器官移植科	4	7	1.0	2.0