基于EST-SNP的福建云霄茶树种质资源遗传多样性分析

• 作者: 王泽涵 于文涛 方德音 蔡捷英 王金焕 樊晓静 刘财国 徐飙 叶乃兴
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 云霄 茶树 种质资源 遗传多样性 SNP
• 年，卷（期）: 2021,（12）
• 所属期刊栏目: 园艺科学|Horticultural Science
• 页码范围: 1431-1438
• 页数: 8页
• 分类号: S571.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2021.12.006

摘要

[目的]分析云霄县茶树种质资源的遗传多样性及群体结构,为云霄茶树种质资源收集和提高优异种质利用率提供依据.[方法]利用SNP分子标记技术对云霄县61份茶树种质资源进行亲缘关系和遗传多样性的分析.[结果]云霄茶树种质资源SNP位点多态性信息指数为0.415,观测杂合度平均值为0.309,期望杂合度平均值为0.260,固定指数平均值为?0.072,次等位基因频率平均值为0.197,筛选出66个可以有效准确地鉴别云霄茶树种质遗传关系的高质量SNP位点.云霄县6个茶树群体的遗传距离为0.150～0.926.构建了61份茶树种质的DNA指纹图谱.通过主坐标分析和聚类分析,发现存在组群内分布相对集中,组群间又相互交流的现象,且小帽山群体的茶树种质资源最为丰富.[结论]云霄县茶树种质资源遗传多样性丰富;云霄6个组群的茶树种质资源各自相对独立,同时种群间存在基因交流现象.利用SNP分子标记技术可以有效地区分鉴定云霄茶树种质资源,为云霄地方茶树种质资源的创新利用奠定基础.