急性髓系白血病中RUNX1突变基因相关预后模型的构建

• 作者: 李娟 马丽 张小晴 童也 李玉云
• 来源期刊: 蚌埠医学院学报
• 关键词: 急性髓系白血病 RUNX1突变型 生物信息学 GEO数据库 预后模型
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 713-717
• 页数: 5页
• 分类号: R733.71
• 语种: 中文
• DOI: 10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2021.06.003

摘要

目的:寻找RUNX1突变型急性髓系白血病(AML)和未突变型AML的差异基因并用来构建预后模型.方法:从RUNX1突变组与未突变组中筛选AML中的差异基因,通过单因素Cox对差异基因进行筛选并构建多因素Cox回归预测模型.根据模型得到病人的风险评分并通过生存曲线和ROC曲线予以评估.结果:从RUNX1突变组与未突变组中筛选得到89个差异基因,其中30个基因上调,59个基因下调.全部的差异基因通过单因素Cox回归筛选,得到38个基因构建多因素Cox回归模型.基于双向逐步回归法进一步筛选得到10个基因,包括BIK、APP、MLLT3、C10orf10、PLXNC1、FHL1、CST3、TGLL1、HOXA5、KIAAO125,使用该10个基因构建预后基因模型,风险评分公式为:风险评分=-0.100×(BIK)+0.215×(APP)+-0.232×(MLLT3)+0.112×(C10orf10)+0.160×(PLXNC1)+0.113×(FHL1)+-0.167×(CST3)+-0.152×(IGLL1)+0.164×(HOXA5)+0.084×(KIAA0125);其中BIK、MLLT3、CST3和IGLL1的风险比小于1,而其他6个基因的风险比大于1.生存分析结果表明高风险评分组的总体生存率明显低于低风险评分组(P<0.01).ROC曲线对未来1、3和5年的总体生存率预测的AUC分别为0.709、0.769和0.771.结论:成功构建突变型AML差异基因预后模型,其中BIK、MLLT3、CST3和IGLL1可能是AML预后保护因素,APP、C10orf10、PLXNC1、FHL1、HOXA5和KIAAO125可能是AML预后的危险因素.