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摘要:
目的 构建人类血液中环状RNA(circRNA)及mRNA的表达谱,分析血液中与衰老相关的差异表达的circRNA,预测其潜在生物学功能和通路.方法 对2017年5月在首都医科大学附属北京安贞医院招募的19对祖孙(老年组和青年组)的38份血液样本进行circRNA/mRNA基因微阵列分析,筛选老年组和青年组血液标本中差异表达的circRNA/mRNA,运用基因本体论和KEGG技术分析这些circRNA涉及的生物学过程和相关信号通路,并依据ceRNA理论构建circRNA-微小RNA-mRNA网络.结果 通过构建的表达谱分析比较老年组和青年组血液中circRNA的表达水平,发现了648个差异性表达的circRNA(141个circRNA上调,507个circRNA下调),959个差异表达的mRNA(230个mRNA上调,729个mRNA下调),基因本体论和KEGG分析表明,这些circRNA可能涉及JNK调节途径、细胞周期相关途径、凋亡细胞清除途径等生物学过程和癌症、碱基切除修复等相关信号通路.共筛选出89个circRNA,6个微小RNA以及59个mRNA成功构建ceRNA调控网络.结论 基因微阵列分析人类血液中circRNA的表达谱,可对其进行潜在功能及通路的预测和分析,本研究可为未来circRNA和衰老的相关研究提供新靶点.
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文献信息
篇名 人体血液中衰老相关的环状RNA的初步筛选和分析
来源期刊 中国医药 学科
关键词 衰老 环状RNA 差异表达 基因表达谱
年,卷(期) 2021,(3) 所属期刊栏目 论著|Original Articles
研究方向 页码范围 452-455
页数 4页 分类号 R339.3
字数 语种 中文
DOI 10.3760/j.issn.1673-4777.2021.03.032
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相关学者/机构
期刊影响力
中国医药
月刊
1673-4777
11-5451/R
大16开
北京市朝阳区安贞路2号首都医科大学附属北京安贞医院北楼二层
80-528
2006
chi
出版文献量(篇)
8947
总下载数(次)
6
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导