福建省宁德港地区2020年夏季鼠形动物汉坦病毒基因特征分析

• 作者: 王秋伟 黄鹏 岳明 黄恩炯 蔡怡珊 梁培栋 姚苹苹 张云 谭伟龙 喻荣彬
• 来源期刊: 中华流行病学杂志
• 关键词: 汉坦病毒 基因变异 遗传进化 鼠形动物
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 实验室研究
• 页码范围: 1266-1273
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn112338-20210126-00065

摘要

目的:分析2020年夏季福建省宁德港地区（宁德港）鼠形动物携带汉坦病毒基因特征及遗传进化关系。方法:夹夜法采集宁德地区鼠类，提取鼠形动物肺组织RNA，用汉坦病毒检测试剂盒对样本进行检测，阳性样本进行全基因组测序，对序列进行相似性、遗传与变异等生物信息学分析。结果:共捕获鼠形动物112只，汉坦病毒阳性率为6.25%（7/112），其中包括褐家鼠5只，黄胸鼠2只；对阳性样本测序，获得2条汉坦病毒的基因全序列（分别命名为：FJ35和FJ36，GenBank登录号：MW449188~MW449193），全基因组序列均来自雄性褐家鼠；序列比对发现该样本所携带病毒属于汉坦病毒基因型汉城病毒（SEOV），与山东省汉坦病毒分离株JX20140581和LZSF21之间核苷酸相似性较高为99%；采用最大似然法构建系统发育树发现该阳性样本所携带病毒属于S3亚型，与浙江省、山东省以及东北地区汉坦病毒分离株Z37、LZSF21和zy27、Gongzhuling415等属于同一亚型；氨基酸序列分析发现，与国际标准株SEOV80-39 M片段编码的氨基酸相比，FJ35和FJ36第81位谷氨酰胺（Q）变为精氨酸（R）；与FJ372核蛋白氨基酸相比发现N259S变异。结论:2020年夏季宁德港鼠形动物汉坦病毒阳性率较高，存在人群自然感染和流行的风险；形成该疫源地的病毒来自山东省某疫区的可能性比较大，需要做好港口鼠形动物的输入性防控；2株阳性样本所携带病毒属于S3亚型，与周围地区病毒株核苷酸及氨基酸同源性较高，但糖蛋白及核蛋白氨基酸存在一些微小的变异，可能引起相关抗原性的改变。