糖尿病肛漏创面应用美洲大蠊提取液的lncRNA高通量测序及维恩图分析

• 作者: 李心甜 马乐 耿越飞 沈咏梅 曾娟妮
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 关键词: 糖尿病 肛漏 美洲大蠊提取液 创面愈合 lncRNA mRNA 高通量测序
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 专题讨论三:中医药数据应用|Thematic Dicussion Ⅲ:Application of Chinese Medicine Data
• 页码范围: 1147-1155
• 页数: 9页
• 分类号: R266
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.20200721012

摘要

目的 基于高通量测序及维恩图预测美洲大蠊提取液促进糖尿病肛漏创面愈合的顺、反式lncRNA及Pathway.方法 选取湖南中医药大学第二附属医院收治的糖尿病肛漏患者术后创面12例,利用高通量测序技术检测6例术后创面组(A组)和6例术后创面应用美洲大蠊提取液创面组(B组)中lncRNAs和mRNAs表达,进行GO分析和KEGG通路分析,构建lncRNA-mRNA的共表达网络图,并通过Cis-及Trans-预测与创面愈合相关lncRNA.结果 实验组差异表达的lncRNAs2242个(上调649个,下调1593个),mRNAs有13186个(上调5162个,下调8024个).GO分析发现差异表达的lncRNA-cis主要富集在表皮细胞分化、上皮细胞分化、细胞代谢过程的调节等;差异表达的lncRNA-trans主要富集在细胞代谢过程、蛋白质结合、细胞内部分等.通过KEGG通路分析,筛选出与本研究相关的3条通路:IBD、MAPK signaling pathway、AMPK signaling pathway;lncRNA靶标基因预测中最终筛选出3个lncRNA(ENST00000443364、ENST00000576797、ENST00000620167),进行PCR验证,lncRNAENST00000443364、ENST00000576797与芯片结果一致.结论 美洲大蠊提取液可能通过lncRNAENST00000443364、ENST00000576797顺式及反式调控靶标基因,影响表皮细胞分化、上皮细胞分化、细胞代谢过程的调节等功能以及影响IBD、MAPK signaling pathway、AMPK signaling pathway促进糖尿病肛漏创面愈合.