奇异变形杆菌临床株对碳青霉烯类耐药的分子机制和同源性

• 作者: 刘入华 李笃军 李宜雷 刘艳飞 董丹丹 朱元祺
• 来源期刊: 中国实验诊断学
• 关键词: 奇异变形杆菌 blaNDM-1 重症监护室 同源性
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 686-690
• 页数: 5页
• 分类号: R378
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-4287.2021.05.014

摘要

目的 探讨ICU患者耐碳青霉烯类奇异变形杆菌临床株的分子机制和同源性.方法 5株奇异变形杆菌分离自ICU患者的痰液或尿液.菌株的鉴定和药敏实验采用梅里埃VITEK 2 Compact系统;PCR方法首先扩增菌株编码碳青霉烯酶基因,然后基于Illumina Miseq和Nanopore MinION技术获得菌株的全基因组序列,并用ResFind-er等软件分析耐药基因和移动元件;菌株之间的同源性检测采用脉冲场凝胶电泳(PFGE);菌株的碳青霉烯基因定位则通过S1核酸酶切脉冲场凝胶电泳(S1-PFGE)和WGS(whole-genome sequencing).结果 这5株奇异变形杆菌的耐药表型和基因型一致,都携带blaNDM-1、blaTEM-1、blaCMY-2和blaOXA-1基因.依据Tonover规则,脉冲场凝胶电泳结果表明这5株菌间存在克隆聚集性.基因组测序和S1核酸酶切脉冲场凝胶电泳结果都证明blaNDM-1基因位于菌株的染色体上.结论 结果表明在ICU存在染色体上携带blaNDM-1、blaTEM-1、blaCMY-2和blaOXA-1基因的奇异变形杆菌的克隆传播.