基于宏基因组学技术不同地区蛋源表面微生物的比较

• 作者: 李侠 温佳奇 王秀娟 宋雨奇 代伟长 王玉华
• 来源期刊: 食品科学
• 关键词: 蛋源 高通量测序 宏基因组学技术 微生物多样性
• 年，卷（期）: 2021,（10）
• 所属期刊栏目: 生物工程|Bioengineering
• 页码范围: 139-145
• 页数: 7页
• 分类号: TS253.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-20200402-026

摘要

采用高通量测序的宏基因组学技术对我国蛋鸡养殖相对集中的吉林、安徽、北京和河北4个地区不同蛋源表面菌群多样性进行分析,比较研究4个地区蛋源表面微生物种类.结果表明:4个地区蛋源表面细菌组成主要是放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria);吉林地区的蛋源样品细菌组成为Actinobacteria、Firmicutes、Proteobacteria,相对丰度分别为49.12％、31.93％和8.41％.安徽、北京和河北地区的蛋源表面细菌组成相似,Proteobacteria、Firmicutes和Proteobacteria,3个地区的优势菌门均为Proteobacteria,丰度均超过50％,分别为77.03％、57.93％和84.28％;不同地区样品微生物属水平也存在较大差异,吉林地区的蛋源样品中丰度较高的菌属为考克氏菌属(Kocuria)和短状杆菌属(Brachybacterium),丰度分别为10.1％和9.83％;安徽、北京和河北3个地区菌属分布较为相似,优势菌属均为不动杆菌属(Acinetobacter),且存在致病菌属,即安徽地区蛋源样品致病菌属为葡萄球菌属(Staphylococcus)丰度为1.20％,北京地区蛋源样品致病菌属为Staphylococcus 3.53％和埃希氏菌志贺氏菌属(Escherichia-Shigella)丰度为3.15％,河北地区蛋源样品致病菌属为假单胞菌属(Pseudomonas)丰度为16.28％.可见不同地区蛋源表面主要微生物门水平和属水平都存在一定差异性,相对丰度差异更显著,北方地区与中部以南地区蛋源表面微生物差异明显(P<0.01),北方地区更适宜禽蛋生产,为保障液蛋制品的安全性,蛋制品企业应该根据蛋源表面微生物组成情况适当调整消毒处理方法,对液蛋制品加工行业有着重要意义.