南宁市37例登革病毒1型E基因系统进化分析

• 作者: 王亮 秦剑秋 尹刘江 杨丞 农皓 唐安达
• 来源期刊: 现代预防医学
• 关键词: 登革病毒1型 E基因 序列测定 系统进化树
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 实验技术及其应用|Experimental Technology and Applications
• 页码范围: 921-924
• 页数: 4页
• 分类号: R512.8
• 语种: 中文

摘要

目的 对南宁市37例登革病毒1型(DENV1)流行株E基因进行序列测定,分析其分子生物学特征,探讨其可能来源.方法 选取2014年12份、2019年25份,共37份经确证为DENV1感染者阳性血浆样本,RT-PCR扩增E基因片段,测序后进行同源性比较、系统进化分析.结果 测序后共获得37条长度为1 437 bp的E基因核苷酸序列,与各参考株E基因序列构建系统进化树后共形成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,3个较大的进化簇,进化簇Ⅰ包括10条2019年DENV1 E基因序列,与参考序列Singapore 2017遗传距离最近,序列相似度99.4％～99.5％;进化簇Ⅱ包括8条2019年DENV1 E基因序列,与参考序列GuangZhou 2018遗传距离最近,序列相似度99.3％～99.5％;进化簇Ⅲ包括7条2019年DENV1 E基因序列和8条2014年DENV1 E基因序列,与参考序列Vietnam 2016遗传距离最近,序列相似度98.4％～98.8％.结论 2019年南宁市输入性DENV1流行株最有可能来源于广州和越南,推断南宁市2019年出现的DENV1本地流行由2014年以来本地进化毒株和新输入毒株共同引起.