2008～2009年南宁市季节性H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因变异分析

• 作者: 刘海燕 林新勤 秦剑秋 范云燕 覃巍巍 黄莉
• 来源期刊: 重庆医学
• 关键词: 流感,人 H1N1 血凝素类 基因变异
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 调查报告
• 页码范围: 329-331
• 页数: 3页
• 字数: 2485字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2013.03.035

摘要

目的 分析南宁市2008～2009年度流行性感冒的病原学监测结果,探讨其季节性H1N1亚型流感病流行情况和HA1基因变异规律及进化趋势.方法 根据流感病原学监测和疫情挑选2008～2009年中分离到的季节性H1N1亚型毒株20株(每年10株),提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒HA基因后进行核苷酸序列测定,利用VectorNTI 9.0分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树.结果 2008～2009年南宁市季节性流感流行主要集中在夏秋季节,H1N1成为2008年度的优势毒株.进化树分析表明,南宁市2008～2009年毒株被分为2个分支(Ⅰ和Ⅱ),A/Solomon/3/2006和A/Brisbane/59/2007分别分布在分支Ⅰ和Ⅱ内.对H1N1 HA1氨基酸序列分析表明,20份毒株二硫键和糖基化位点比较保守,受体结合位点(RBS)和抗原决定簇位点相对活跃,其中RBS 188、189、222、224 均发生了不同程度的变异.与A/Solomon /3/2006相比,2008年毒株抗原决定簇存在4个氨基酸的替换并且分布在两个抗原决定簇区域,2009年毒株除A/nanning/473/2009外,抗原决定簇区氨基酸变异未达到4个.结论 南宁市2009年H1N1流感病毒HA1基因特性与A/Brisbane/59/2007疫苗株接近,2008年毒株与两疫苗株相比变异较大,这可能是导致2008年南宁市 H1N1亚型流感病毒流行强度明显增加的原因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林新勤		27	109	5.0	8.0
2	秦剑秋		3	1	1.0	1.0
3	黄莉		31	134	6.0	11.0
4	刘海燕		12	32	3.0	5.0
5	覃巍巍		2	1	1.0	1.0
6	范云燕		2	1	1.0	1.0