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2008~2009年南宁市季节性H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因变异分析
2008~2009年南宁市季节性H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因变异分析
作者:
刘海燕
林新勤
秦剑秋
范云燕
覃巍巍
黄莉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
流感,人
H1N1
血凝素类
基因变异
摘要:
目的 分析南宁市2008~2009年度流行性感冒的病原学监测结果,探讨其季节性H1N1亚型流感病流行情况和HA1基因变异规律及进化趋势.方法 根据流感病原学监测和疫情挑选2008~2009年中分离到的季节性H1N1亚型毒株20株(每年10株),提取病毒RNA,采用RT-PCR扩增病毒HA基因后进行核苷酸序列测定,利用VectorNTI 9.0分析处理,并与WHO推荐疫苗株进行比对,用Mage 4.1构建系统进化树.结果 2008~2009年南宁市季节性流感流行主要集中在夏秋季节,H1N1成为2008年度的优势毒株.进化树分析表明,南宁市2008~2009年毒株被分为2个分支(Ⅰ和Ⅱ),A/Solomon/3/2006和A/Brisbane/59/2007分别分布在分支Ⅰ和Ⅱ内.对H1N1 HA1氨基酸序列分析表明,20份毒株二硫键和糖基化位点比较保守,受体结合位点(RBS)和抗原决定簇位点相对活跃,其中RBS 188、189、222、224 均发生了不同程度的变异.与A/Solomon /3/2006相比,2008年毒株抗原决定簇存在4个氨基酸的替换并且分布在两个抗原决定簇区域,2009年毒株除A/nanning/473/2009外,抗原决定簇区氨基酸变异未达到4个.结论 南宁市2009年H1N1流感病毒HA1基因特性与A/Brisbane/59/2007疫苗株接近,2008年毒株与两疫苗株相比变异较大,这可能是导致2008年南宁市 H1N1亚型流感病毒流行强度明显增加的原因.
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篇名
2008~2009年南宁市季节性H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因变异分析
来源期刊
重庆医学
学科
关键词
流感,人
H1N1
血凝素类
基因变异
年,卷(期)
2013,(3)
所属期刊栏目
调查报告
研究方向
页码范围
329-331
页数
3页
分类号
字数
2485字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1671-8348.2013.03.035
五维指标
作者信息
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林新勤
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重庆医学
主办单位:
重庆市卫生信息中心
重庆市医学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1671-8348
CN:
50-1097/R
开本:
大16开
出版地:
重庆市渝北区宝环路420号
邮发代号:
78-27
创刊时间:
1972
语种:
chi
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30732
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