骨质疏松性椎体骨折的差异表达miRNA分析及miRNA-mRNA调控网络构建

• 作者: 张逢乐 杨辉
• 来源期刊: 按摩与康复医学
• 学科: 医学
• 关键词: 骨质疏松性椎体骨折 miRNA GEO数据库 miRNA-mRNA 差异表达
• 年，卷（期）: 2021,（23）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 67-71
• 页数: 5页
• 分类号: R683
• 语种: 中文
• DOI: 10.19787/j.issn.1008-1879.2021.23.022

摘要

目的:筛选骨质疏松性椎体骨折中差异表达miRNA,并构建骨质疏松性椎体骨折中miRNA-mRNA调控网络.方法:通过GEO在线数据库查找骨质疏松性椎体骨折的miRNA表达谱,借助GEO2R进行差异表达miRNA分析并筛选差异表达miRNA(|logFC|＞1且adj.P值＜0.05),借助火山图对差异表达miRNA进行展示,利用TargetScan和miRDB在线数据库预测靶基因,最后通过Cytoscape软件进行miRNA-mRNA调控网络可视化.结果:通过筛选,本研究得到181个差异表达miRNA,其中表达上调98个,表达下调83个.差异表达上调前10位的miRNA包括hsa-miR-205-5p、hsa-miR-660-5p、hsa-miR-155-5p等.差异表达下调的前10的miRNA包括hsa-miR-4508、hsa-miR-1273a、hsa-miR-1253等,其中排名前三的miRNA分别为hsa-miR-205-5p、hsa-miR-660-5p、hsa-miR-155-5p.通过在线数据库TargetScan、miRDB对目标miRNA进行靶基因预测,本研究得出hsa-miR-155-5p预测到280个靶基因,hsa-miR-205-5p预测到304个靶基因,hsa-miR-660-5p预测到294个靶基因.结论:基于GEO数据库挖掘,本研究发现了差异表达miRNA,成功构建骨质疏松性椎体骨折的miRNA-mRNA调控网络图,为骨质疏松性椎体骨折的诊断和治疗筛选出重要的生物标志物.