木奶果种质资源的遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

• 作者: 周彩霞 罗培四 孔方南 蒋娟娟 卓福昌 李文砚 周婧 韦优
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 木奶果 种质资源 SCoT分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
• 年，卷（期）: 2022,（5）
• 所属期刊栏目: 专题：热带水果
• 页码范围: 1207-1215
• 页数: 8页
• 分类号: S667.902.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2022.05.002

摘要

【目的】对来自广西、云南、海南和广东的63份木奶果种质资源进行遗传多样性分析,并构建对应的DNA指纹图谱，为木奶果种质资源的分类鉴定、保护和利用提供理论参考。【方法】选取3份地理位置相差较远的种质，从75条SCoT引物中筛选出条带清晰、重复性好和多态性丰富的引物，对63份供试种质进行多态性扩增，利用Popgene 1.32和NTsys 2.10e进行遗传多样性和聚类分析，并依据扩增结果构建DNA指纹图谱。【结果】筛选出的6条SCoT引物从63份木奶果种质资源中共扩增出192条带，其中多态性条带188条，多态性比率为97.86%；每条引物扩增的条带数为26~36条，平均为32条，多态性条带数为26~36条，平均每条引物可扩增出31.33条多态性条带，多态性比率为90.00%~100.00%；多态性信息含量值（PIC）为0.9052~0.9527，平均0.9319，Shannon's信息指数（I）在0.2459~0.3878，Nei's基因多样性（H'）为0.1476~0.2412，等位基因数（Na）为1.9000~2.0000，有效等位基因数（Ne）为1.2324~1.3700。6条SCoT引物扩增出的多态性条带存在明显差异，单条引物可区分的种质份数为49~63份，平均为58份。供试材料间的遗传相似系数（GS）为0.5781~0.9115，平均为0.7496，在遗传相似性系数为0.7100处被分为5个组，其中A组为2份广西的种质、B组为1份广西的种质；C组为4份云南的种质；D组为海南和广东的全部种质；E组为剩余的50份种质。将进一步筛选出的5条SCoT引物（SCoT32、SCoT66、SCoT68、SCoT73和SCoT74）用于初步构建63份木奶果种质资源的DNA指纹图谱，每份种质均有唯一对应的图谱。【结论】供试的63份木奶果种质资源具有丰富的遗传多样性，种质间的亲缘关系与地域有一定的相关性。所筛选的6条SCoT引物具有较强的多态性，适用于木奶果种质资源的评价鉴定、遗传多样性分析及指纹图谱构建等研究。