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调控网络分析肺栓塞患者外周血中lncRNAs、miRNAs和mRNAs的差异表达
调控网络分析肺栓塞患者外周血中lncRNAs、miRNAs和mRNAs的差异表达
作者:
何丽丽
曹国磊
马荣辉
唐乐
佟玉珊
李宏
罗琴
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肺栓塞
高通量测序
长链非编码RNA
小RNA
信使RNA
摘要:
目的 研究肺血栓栓塞症(Pulmonary thromboembolism,PTE)患者外周血中长链非编码RNA(LncRNA)、小RNA(miRNA)和信使RNA(mRNA)的差异表达.方法 收集2019年1—12月就诊于新疆医科大学附属肿瘤医院呼吸神经内科确诊为PTE患者(PTE组)和健康体检者(对照组)的外周血各4例,采用TRIzol?Reagent提取总RNA,利用Illumina高通量测序技术进行基因测序,筛选两组差异表达基因,包括lncRNA、miRNA、mRNA.对DEGs(差异表达基因)进行基因本体论(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)途径网络分析.构建PTE患者的miRNA-mRNA-ln-cRNA网络.结果 在PTE组和对照组外周静脉血中共鉴定出2014个差异表达DEGs,包括430个lncRNA、63个miRNA、1521个mRNA(P均<0.05).GO及KEGG分析显示DEGs主要参与的通路有基因表达、Wnt信号通路、细胞周期蛋白激酶1(PLK1)在G2/M期的活性调节、TLR级联中MAP激酶的活化、细胞周期、DNA重建等.分析miRNA-mRNA及miRNA-lncRNA调控关系并基于mRNA-lncRNA调控网络预测ceRNA,结果显示调控关系最多的miRNA为miR-1260和miR-1260a.结论 调控网络分析能够用有效分析健康人群与肺栓塞患者血液中的差异表达基因,这些基因或可作为肺栓塞诊治的新靶点.
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文献信息
篇名
调控网络分析肺栓塞患者外周血中lncRNAs、miRNAs和mRNAs的差异表达
来源期刊
新疆医科大学学报
学科
医学
关键词
肺栓塞
高通量测序
长链非编码RNA
小RNA
信使RNA
年,卷(期)
2022,(1)
所属期刊栏目
专题研究|Monographic Research
研究方向
页码范围
1-7
页数
7页
分类号
R734
字数
语种
中文
DOI
10.3639/j.issn.1009-5551.2022.01.001
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(0)
节点文献
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二级引证文献
(0)
2022(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
肺栓塞
高通量测序
长链非编码RNA
小RNA
信使RNA
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
新疆医科大学学报
主办单位:
新疆医科大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-5551
CN:
65-1204/R
开本:
大16开
出版地:
新疆乌鲁木齐市新医路393号
邮发代号:
58-100
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
9362
总下载数(次)
4
总被引数(次)
36538
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
新疆维吾尔自治区自然科学基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
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