基于环境DNA宏条形码技术的辽东湾典型围海养殖池塘内水母多样性研究

• 作者: 李玉龙 鲍相渤 李轶平 周遵春 付杰 高祥刚 陈百灵 李云峰
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 水母 环境DNA宏条形码 18SrDNA 细胞色素C氧化酶亚基I(COI) 物种检测 早期监测与预警
• 年，卷（期）: 2022,（13）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 5303-5313
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.5846/stxb202102170448

摘要

研究使用环境DNA宏条形码技术(eDNA metabarcoding)检测辽东湾东北部河口区围海养殖池塘水母种类多样性,探索适用于水母种类物种鉴定和监测的新方法。利用环境DNA宏条形码技术,分别基于18S rDNA和COI宏条形码检测了辽东湾东北部河口区围海养殖池塘水母种类多样性,通过水样采集、过滤、eDNA提取、遗传标记扩增、测序与生物信息分析的环境DNA宏条形码标准化分析流程,从围海养殖池塘7个采样点中获得可检测的采样点数据。结果显示,基于18S rDNA宏条形码检测出8种水母种类,其中钵水母纲大型水母2种、水螅水母总纲小型水母6种;基于COI宏条形码技术共检测出19种水母种类,其中钵水母纲大型水母5种、水螅水母总纲小型水母14种;两种DNA条形码标记都显示养殖种类海蜇(Rhopilema esculentum)为优势种。研究结果表明,环境DNA宏条形码技术作为一种新兴的生物多样性监测手段可用于快速检测水母种类多样性,在水母类物种鉴定、监测及早期预警中有较大的应用潜能。