类风湿关节炎与骨质疏松症的生物信息学分析

• 作者: 蔡鑫 唐芳 马武开 蒋总 金泽旭 樊梅
• 来源期刊: 中国骨质疏松杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 类风湿关节炎 骨质疏松症 生物信息学 信号通路
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 386-391,402
• 页数: 7页
• 分类号: R593.22|R681
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-7108.2022.03.015

摘要

目的 利用生物信息学分析类风湿关节炎(RA)与骨质疏松症(OP)的关系.方法 通过Genecards、OMIM、TTD等数据库查找RA和OP的疾病基因,对两组疾病的基因取交集,将共同基因导入STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络图,使用R软件筛选出PPI网络中的关键基因,利用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析.结果 通过检索数据库筛选出RA相关基因5388个、OP相关基因4587个,取交集后获得共同靶点基因1899个,PPI网络图显示IL-6、INS、AKT1、TNF、TP53、VEGFA、EGFR等为RA与OP的共同关键基因,GO富集主要与受体配体活性、细胞因子受体结合、囊泡、T细胞活化、肽分泌的调节等相关,KEGG信号通路包括PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路、破骨细胞分化、细胞凋亡、Th17细胞分化等.结论 所获得RA与OP的共同关键基因和涉及的信号通路,有助于理解两者在疾病过程中的相关性,为药物的研发提供理论参考.