转录组测序分析甘蓝型油菜DW871矮化性状

• 作者: 罗京 李超 张瑞茂 赵德刚 高志宏 王芳 杨元雨 王转转 王敏
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜(Brassica napus L.) 转录组 矮化性状 DW871 株型
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 特色专题·适宜机械化作业的油菜种质创制及相关性状基因挖掘
• 页码范围: 14-24
• 页数: 11页
• 分类号: S565.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2021044

摘要

DW871是一个具有特异株型的甘蓝型油菜矮化品系.为了研究DW871的相关基因及其表达模式,我们以甘蓝型高秆油菜HW871为对照,选取抽薹期茎秆组织进行转录组基因表达分析.结果显示:DW871与HW871之间存在8665个显著差异基因,其中上调基因2582个,下调基因6083个.通过GO富集分析可注释到3个大类共22个亚类中.通过KEGG富集分析注释到5个大类31个亚类共295个通路中.我们从显著差异基因中筛选了与矮化性状密切相关的基因,在果胶降解代谢途径中注释到了43个差异基因;在生长素信号转导途径中注释到了69个差异基因;在木质素单体合成途径中注释到22个差异基因.发现DW871的矮化性状与细胞伸长、细胞壁形成和细胞分裂的异常以及生长素信号传导的受阻有关.尤其在木质素单体合成途径中的,可能通过调控PAL和CCR等酶的表达,改变木质素的合成速率和组成,进而对一系列与木质素相关的生理生化过程进行调控.因此提出DW871的矮化机制,即生长素应答和木质素合成的异常,造成了细胞伸长、生长和细胞壁变化的异常,并最终导致了DW871的矮化.