定量蛋白质组学分析SDF2L1过表达后鼻咽癌细胞中的差异蛋白

• 作者: 罗承长 苏琪盛 黎小红 杨峥 莫武宁
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: SDF2L1 鼻咽癌 非标记定量蛋白质组学 生物信息学
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 437-442
• 页数: 6页
• 分类号: R739.62
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2022.03.016

摘要

目的:分析基质细胞衍生因子2样1(SDF2L1)过表达对人鼻咽癌(NPC)细胞5-8F中蛋白表达谱的影响.方法:提取SDF2L1基因过表达细胞株(5-8Fg)及空载细胞株(5-8F1)的总蛋白,利用非标记定量(LFQ)蛋白组学技术和串联质谱分析技术筛选差异表达蛋白(DEPs),应用R软件对DEPs进行GO和KEGG富集分析,Cytoscape软件筛选关键的DEPs,Oncomine数据库对关键DEPs进行验证,RT-qPCR和western blotting法对筛选出来的关键DEPs进行验证.结果:在5-8Fg细胞中共筛选出730个DEPs,其中296个DEPs上调,434个DEPs下调.富集分析结果显示,DEPs主要定位在核糖体中,参与核糖体合成和内质网蛋白加工等过程,发挥黏附蛋白和催化活性等功能.通过Cytoscape和Oncomine数据库验证出核糖体蛋白L14(RPL14)、RPS15A等9个关键DEPs.SDF2L1过表达后RPL14基因(P＜0.05)表达下调.结论:SDF2L1过表达后显著改变了NPC细胞中的蛋白表达特征,RPL14可能是NPC的促癌因子.