基于TCGA数据库构建雌激素受体阳性乳腺癌患者的预后风险模型

• 作者: 杨燕 贺鑫 龚鹏举 宋文静 魏蕾 张京伟
• 来源期刊: 武汉大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 雌激素受体阳性乳腺癌 miRNA TCGA 列线图
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 肿瘤学研究
• 页码范围: 243-249
• 页数: 7页
• 分类号: R737.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.14188/j.1671-8852.2020.0749

摘要

目的:构建微小RNA(miRNA)表达的预测雌激素受体(ER)阳性乳腺癌患者预后的风险模型.方法:分析了TCGA数据库下载的ER阳性乳腺癌患者的miRNA表达数据和临床资料,筛选出与ER阳性乳腺癌特异性相关的miRNA并构建了miRNA-临床的预测ER阳性乳腺癌患者3年和5年生存率的预测模型.受试者工作曲线(ROC)和校准曲线用于评估列线图的预测能力和准确性.最后分析了miRNA在他莫昔芬治疗复发组与未复发组的表达情况.使用DAVID工具进行miRNA靶基因的GO功能富集和KEGG信号通路富集.结果:Lasso回归分析最终得到与预后相关的4个miRNA(miR-331、miR-615、miR-653、miR-887)并计算风险评分,风险评分可以有效地区分低风险患者和高风险患者.随后,我们构建了包含风险评分和临床特征的预后模型.曲线下面积(AUC)显示,该模型具有较好的预测能力和准确性(3年A UC=0.768,5年AUC=0.849).GSE37405数据集中miRNA表达分析显示miR-331在他莫昔芬治疗复发组的表达明显高于他莫昔芬治疗未复发组(P=0.018).GO功能富集分析和KEGG信号通路分析表明,miR-331的靶基因主要参与蛋白质结合、转录调控和mRNA监视途径.结论:我们构建了miRNA-临床的预后模型,该模型可有效预测ER阳性乳腺癌患者的3年和5年生存率,并有利于制定个体化治疗决策.