基于虚拟筛选从中药中发现抗铜绿假单胞菌的活性成分

• 作者: 徐明鑫 陈双扣 管天冰 任风鸣 滕金凤 谭小庆
• 来源期刊: 化学研究与应用
• 学科: 医学
• 关键词: 铜绿假单胞菌 分子对接 虚拟筛选 中药成分
• 年，卷（期）: 2022,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Academic Papers
• 页码范围: 754-763
• 页数: 10页
• 分类号: R284
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1656.2022.04.008

摘要

针对铜绿假单胞菌的耐药性问题,采用虚拟筛选技术快速筛选出具有抗铜绿假单胞菌活性的中药成分.采用AutoDock Vina程序对铜绿假单胞菌LasR信号受体蛋白的2UV0、3IX3和6MVM三个共晶结构进行方法学研究,然后利用Lipinsky规则对陶术中药数据库进行初步筛选,通过分子对接进行再次筛选,并对满足Lip-insky规则且结合能低于阈值的化合物开展体外抑菌实验.研究结果表明3IX3靶点蛋白分子对接模型具有较强的活性分子富集能力,基于该模型对陶术中药数据库进行虚拟筛选后发现符合Lipinsky规则且结合能低于阈值的化合物7个,目筛后得到潜在活性分子5个,体外抑菌实验发现黄芩素-7-甲醚有明显抗菌活性,其最小抑菌浓度为500μg·mL-1.本研究理论结合实验发现黄芩素-7-甲醚有较好的抗铜绿假单胞菌活性,对抗菌新药的研发具有一定的参考价值.