放牧藏猪、舍饲藏猪与商品猪粪便真菌群落组成及其与饲粮纤维消化的相关性研究

• 作者: 谭占坤 池福敏 商振达 商鹏 刘锁珠 强巴央宗
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 藏猪 商品猪 真菌群落 纤维消化 相关性分析
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告|RESEARCH ARTICLES
• 页码范围: 259-274
• 页数: 16页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20210215

摘要

[目的]研究饲养在西藏高原的放牧藏猪、舍饲藏猪和商品猪(杜长大猪,DLY猪)粪便中真菌群落组成的差异性,获取与饲粮粗纤维消化相关的真菌群落.[方法]以饲养在西藏高原的5月龄放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪为研究对象,采用消化试验测定放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪对饲粮粗纤维的表观消化率.采集粪便样品利用单分子实时测序技术(SMRT),测定粪便真菌ITS基因全长序列,分析粪便真菌群落的结构和多样性,采用Pearson相关分析获取饲粮粗纤维表观消化率与真菌群落的相关性.[结果]在放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪的粪便样品中共鉴定出了 4个门、13个纲、23个目、39个科、55个属、58个种,放牧藏猪在各分类水平的分类单元数均显著高于舍饲藏猪与DLY猪(P＜0.05).子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)是优势菌门,在门水平下,放牧藏猪、舍饲藏猪和DLY猪间无显著差异(P≥0.05),但在纲、目、科、属、种水平下,放牧藏猪多个真菌类群相对丰度显著高于舍饲藏猪与DLY猪(P＜0.05).放牧藏猪具有更高的菌群丰富度和独有分类操作单元(OTU)(P＜0.05),通过主坐标分析发现放牧藏猪粪便真菌群落与舍饲藏猪和DLY猪之间差距明显.放牧藏猪对饲粮粗纤维的表观消化率显著高于舍饲藏猪与 DLY 猪(P＜0.05),Pearson 相关性分析表明,Phialemonium atrogriseum、Phialemonium inflatum、Podospora communis与饲粮粗纤维表观消化率呈显著正相关(P＜0.05).[结论]放牧藏猪具有较强的纤维消化能力,可以从其肠道内鉴定出更丰富的真菌类群并进行深入开发,有利于进一步研究藏猪耐粗饲等优良特性.