基于网络药理学探讨丹红化瘀口服液治疗深静脉血栓的作用机制

• 作者: 黄博宁 林娟 彭思远 陈子健 林超 林宝琴
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 网络药理学 丹红化瘀口服液 深静脉血栓 活性成分 靶点 作用机制
• 年，卷（期）: 2022,（6）
• 所属期刊栏目: 丹红化瘀研究专栏|Special Column of Danhong Huayu Study
• 页码范围: 1652-1662
• 页数: 11页
• 分类号: R285.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2022.06.007

摘要

目的 基于网络药理学方法探讨丹红化瘀口服液治疗深静脉血栓(deep vein thrombosis,DVT)的作用机制.方法 利用中药系统药理学技术平台数据库(TCMSP)获取丹红化瘀口服液的主要化学成分及作用靶点,利用Uniprot数据库对获取的作用靶点进行规范化处理;通过DisGeNet、GeneCards、OMIM、DrugBank数据库获取DVT相关靶点;利用Venny2.1.0绘图网站构建Venn图,得到丹红化瘀口服液与DVT的交集靶点;应用String平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;通过David数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,使用微生信网站绘制结果气泡图,并利用KEGG Mapper平台制作通路机制图;相关结果采用Cytoscape 3.7.2软件进行可视化研究及网络拓扑结构分析.结果 经过数据库分析共筛选丹红化瘀口服液化学成分130个,潜在作用靶点268个,其中涉及DVT靶点136个."中药-成分-疾病靶点"网络显示,槲皮素、木犀草素、山柰酚等是丹红化瘀口服液治疗DVT的主要活性成分,转录因子AP-1(transcription factor AP-1,JUN)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、IL-6、信号传导与转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)等是丹红化瘀口服液治疗DVT的核心靶点.通过GO功能富集分析得到211条生物进程条目,124条分子功能条目,72条细胞成分条目.通过KEGG通路富集分析,得到3条与DVT相关的通路,即胞内磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia-inducible factor-1,HIF-1)信号通路.结论 丹红化瘀口服液可通过多成分、多靶点和多通路发挥治疗DVT的作用,为拓宽其临床用途提供基础.