高原兔肠道菌群多样性分析

• 作者: 龙鑫 候建平 郑思思 李佳妮 王稳 朱丽琳
• 来源期刊: 中国兽医杂志
• 关键词: 高原兔 肠道菌群 16S rDNA高通量测序技术 细菌分离培养 耐药性
• 年，卷（期）: 2023,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 27-33
• 页数: 6页
• 分类号: Q958.12
• 语种: 中文

摘要

为探究高原兔(Lepus oiostolus)肠道菌群多样性，本试验利用16S rDNA高通量测序方法分析高原兔小肠和大肠部位菌群种类及相对丰度，同时利用不同培养基对高原兔新鲜粪便中的微生物进行分离培养，并进一步对获得的菌株进行耐药性分析。16S rDNA高通量测序结果显示，高原兔小肠和大肠部位菌群在菌门水平主要由拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、互养菌门(Synergistetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)组成。优势菌属主要包括肠杆菌属(Enterobacter)、理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae RC9 gut group)、拟杆菌属(Bacteroides)、克里斯滕森菌科R-7群(Christensenellaceae R-7 group)。基于细菌培养分离方法共分离到25株细菌，隶属于6属、9种。耐药性分析发现，分离菌株对3～27种抗菌药物表现出耐药性。其中2种潜在有益菌株对5种常见肠道致病菌表现出一定的抑制能力。本试验结果为深入了解高原兔肠道微生物组提供了基础数据。