非复制型尿嘧啶营养缺陷型弓形虫刺激雏鸡脾脏的转录组学分析

• 作者: 吴绿怡 刘思勤 廖艳鹏 任超 天津农学院动物科学与动物医学学院/天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室
• 来源期刊: 南方农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 非复制型尿嘧啶营养缺陷型弓形虫 雏鸡 转录组学 脾脏 免疫
• 年，卷（期）: 2024,（3）
• 所属期刊栏目: 专题：转录组测序
• 页码范围: 134-143
• 页数: 10页
• 语种: 中文

摘要

【目的】探究非复制型尿嘧啶营养缺陷型弓形虫（NRTUAs）感染雏鸡脾脏的转录组学变化，明确NRTUAs对雏鸡脾脏先天性免疫的调节效果，为研发家禽抗弓形虫疫苗提供理论依据。【方法】分别以NRTUAs和磷酸盐缓冲液（PBS）感染14日龄雏鸡，感染后第3 d采集脾脏组织样品进行转录组测序，筛选出NRTUAs组与PBS组间的差异表达基因（DEGs），然后进行GO功能注释、KEGG信号通路富集及蛋白调控网络分析，并通过实时荧光定量PCR验证转录组测序的准确性。【结果】与PBS组相比，从感染NRTUAs的雏鸡脾脏中筛选出499个DEGs(286个为上调DEGs,213个为下调DEGs)，且NRTUAs组中上调表达的DEGs多于下调表达的DEGs。GO功能注释分析发现，DEGs注释在生物过程（Biological process,BP）、细胞组分（Cellular component,CC）和分子功能（Molecular function,MF）三大类别的58个功能条目上，主要涉及端粒蛋白定位建立正调控、蛋白稳定、含伴侣蛋白T-复合物、内质网腔、内质网、内质网膜组成部分、纺锤中央区及未折叠蛋白结合等功能条目；KEGG信号通路富集分析显示，DEGs主要富集在内质网蛋白加工通路、RNA转运、细胞周期、钙信号通路、黏着斑、细胞衰老、神经活性配体—受体相互作用、细胞因子—细胞因子受体相互作用通路及氨基酸生物合成等通路中；蛋白互作网络分析结果表明，DEGs编码蛋白PLK1、CCNB1、CDK1、CDC20、CCNA2和NDC1均在细胞周期通路上调表达。实时荧光定量PCR验证结果显示，只有2个DEGs(CXCL12和VPREB3)呈上调表达，其余8个DEGs呈下调表达，与转录组测序结果基本一致。【结论】感染NRTUAs后雏鸡脾脏免疫相关基因表达上调，且多数DEGs富集在内质网蛋白合成与细胞周期等相关信号通路上，脾脏细胞活动明显增强，即通过加快建立细胞连接及启动先天性免疫反应而积极对抗弓形虫入侵。