基于转录组测序分析枸杞多糖对免疫抑制雏鸡脾脏基因表达的影响

• 作者: 王建东 唐玉林 王敏 张宝锁 杨富强 高海慧 于洋 郭延生
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 枸杞多糖 雏鸡 环磷酰胺 转录组学
• 年，卷（期）: 2024,（3）
• 所属期刊栏目: 专题：转录组测序
• 页码范围: 64-74
• 页数: 11页
• 语种: 中文

摘要

【目的】利用转录组测序技术分析枸杞多糖（LBP）对免疫抑制雏鸡脾脏基因表达的影响，挖掘LBP修复雏鸡免疫抑制的靶基因，为探究枸杞多糖对雏鸡免疫抑制的修复机制提供理论依据。【方法】将120羽7日龄海兰褐蛋鸡随机分成空白组（NC）、环磷酰胺（CTX）组（CY）和LBP组（CYLbGp）,NC组肌注生理盐水，其余2组连续3 d肌注80 mg/（kg·d）CTX造模，造模后通过测定血清中IL-2、IL-6和INF-γ含量对免疫抑制雏鸡模型进行验证。造模成功后在CYLbGp组饮水中加入5 mg/（kg·d）LBP，给药结束后采集脾脏进行转录组测序，以P<0.05和|log2 Fold change|≥1为条件筛选出差异表达基因（DEGs），并进行GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析，以探究枸杞多糖对免疫抑制的修复作用。【结果】共获得1049301886个Raw reads，对其进行质控、过滤后，共获得1032097278个Clean reads。CY组和NC组之间共有701个DEGs,CYLbGp组和CY组之间共有748个DEGs。GO功能注释显示，LBP干预后显著回调的DEGs主要与结合、细胞过程、生物调节及细胞组分等功能相关。KEGG信号通路富集结果显示，LBP干预后显著回调的DEGs主要与神经活性配体-受体相互作用和视黄醇代谢通路相关，筛选出所富集的通路中关键的DEGs为人毒蕈碱型胆碱受体M5基因（CHRM5）、烟碱型乙酰胆碱受体β4基因（CHRNB4）、代谢型型谷氨酸受体1基因（GRM1）、胆囊收缩素基因（CCK）、神经肽Y1受体基因（NPY1R）、细胞色素P450家族成员2C18基因（CYP2C18）、血管紧张素Ⅱ受体1基因（AGTR1）、细胞色素P450家族成员3A5基因（CYP3A5）、丝氨酸蛋白酶2(PRSS2)和神经紧张素基因（NTS）。RT-qPCR结果与转录组学数据变化趋势基本一致，表明转录组数据有较高的可靠性。【结论】LBP修复雏鸡免疫抑制的作用机制可能与调节神经活性配体-受体相互作用和视黄醇代谢通路有关，其中CHRM5、CHRNB4、GRM1、CCK、NPY1R、CYP2C18、AGTR1、CYP3A5、PRSS2和NTS可作为LBP修复雏鸡免疫抑制的靶基因。