基于转录组测序对小麦抗叶锈性相关基因的筛选与分析

• 作者: 刘大群 张艳俊 杨毅清 王海燕 袁心悦
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 差异基因 GO富集 KEGG数据库 qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 页码范围: 11-16
• 页数: 6页
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2020.0002

摘要

为了探明小麦'TcLr19'抵抗小麦叶锈菌侵染的内在分子机制,挖掘与抗叶锈菌密切相关的功能基因,对接种叶锈菌后的小麦材料'TcLr19'进行Illumina NextSeq500转录组测序.筛选到差异表达的基因(Differential expression genes,DEGs)8970个,其中上调差异表达基因4953个,下调差异表达基因4017个.差异基因通过GO(Gene Ontology)功能分类和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes)Pathway富集分析,被归于1790个GO类别,定位到84个代谢通路中.采用实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)对转录组分析结果进行验证,结果表明,qRT-PCR与RNA-seq分析结果基本一致,为小麦TcLr19抗小麦叶锈菌新基因的挖掘提供了可靠的参考资料.