基于生物信息学筛选急性心肌梗死后心力衰竭差异表达基因及潜在干预中药

• 作者: 乔利杰 王建茹 李彬 朱明军
• 来源期刊: 中西医结合心脑血管病杂志
• 关键词: 急性心肌梗死 心力衰竭 生物信息学 差异表达基因 中药
• 年，卷（期）: 2024,（17）
• 所属期刊栏目: 临床医学论著
• 页码范围: 29-39
• 页数: 11页
• 语种: 中文

摘要

目的:利用生物信息学技术分析急性心肌梗死后心力衰竭(HFpAMI)的差异表达基因(DEGs),并对干预DEGs的中药进行预测，为深入探索HFpAMI相关作用机制及干预中药的用药规律提供科学依据。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中获取GSE59867数据集中有关急性心肌梗死后的心力衰竭(HF)和非心力衰竭样本；利用Limma包筛选两组样本间的DEGs,通过基于本体的医学信息检索平台(Coremine Medical)数据库预测干预DEGs的中药，收集其性味归经及功效等信息。利用WGCNA获取与临床性状相关性最高的基因模块，再与DEGs取交集后获得次Hub基因，构建次Hub基因的蛋白互作网络并进行模块分析，筛选Hub基因，并对单个Hub基因进行基因集富集分析(GSEA)。结果:共鉴定出140个DEGs和10个Hub基因，10个Hub基因为分化抗原28(CD28)、原癌基因c-Fos(FOS)、白细胞介素-2受体α亚型(IL2RA)、B淋巴细胞抗原CD20(MS4A1)、Rho相关GTP结合蛋白(RHOH)、分化抗原24(CD24)、假定P2Y嘌呤受体10(P2RY10)、二肽基肽酶4(DPP4)、血小板反应蛋白-1(THBS1)、2型补体受体(CR2)。GSEA共发现19条信号通路，涉及免疫损伤和炎症介导的多个生物学过程及信号通路，其中以补体及凝血级联最为关键。中药预测结果显示：潜在干预HFpAMI的中药药性多为性温、性寒，药味以苦、甘多见，多归为肝、脾、肺经，以补虚药、清热药、活血化瘀药为主。结论:本研究挖掘出HFpAMI 10个潜在关键基因，同时，还发现与干预HFpAMI相关的中药大多归肝、脾、肺经，性味多为温、寒、苦、甘，功效多为补虚、清热、活血化瘀。在一定程度上为中医临床遣方用药治疗HFpAMI以及进一步开展探索性实验研究提供了借鉴和思路。