基于SSR标记构建江西杉木核心种质及其分子身份证

• 作者: 娄永峰 朱柯帆 宋晓琛 冷春晖 陈兴彬 肖复明
• 来源期刊: 林业科学研究
• 学科: 农学
• 关键词: 杉木;遗传多样性;核心种质;分子身份证;SSR标记
• 年，卷（期）: 2023,（6）
• 页码范围: 82-90
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.12403/j.1001-1498.20230163

摘要

[目的]分析江西杉木种质资源的遗传多样性，构建其核心种质；在此基础上，构建核心种质分子身份证，为江西杉木种质的进一步研究与利用提供理论依据和核心材料。[方法]以江西地区的杉木种质为材料，利用SSR标记开展遗传多样性分析，并基于等位基因数最大化原则（M策略）构建核心种质，通过遗传多样性参数及其保留比例进行核心种质评价，结合遗传多样性参数的t检验和主坐标分析（PCoA）验证和确认核心种质的代表性。基于最少标记鉴定最多种质的原则，选择高效SSR标记，构建江西杉木核心种质的SSR分子指纹图谱和分子身份证。[结果]20个SSR标记在495份种质中共检测到122个等位基因数（Na），平均Shannon's信息指数（I）、平均Nei's遗传多样性指数（H）、平均观测杂合度（H_o）和平均期望杂合度（He）分别为0.762、0.400、0.394和0.400，表明江西杉木种质的遗传多样性较丰富。采用M策略构建了含有52份材料的江西杉木核心种质，10.5%的核心种质保留了原种质100.0%的Na、107.4%的有效等位基因数（Ne）、115.1%的I、109.0%的H、104.1%的H_o、110.0%的He和111.2%的PIC; t检验表明以上遗传多样性参数与原种质均没有显著差异，主坐标分析（PCoA）显示核心种质在原种质的主坐标图分布均匀，说明构建的核心种质具有代表性。按多态性信息含量（PIC）值高低顺序，依次增加标记数量，结合UPGMA聚类，发现4个SSR分子标记，H97与H286、CLSSR9、CLSSR37相结合，可将52份江西杉木核心种质鉴别，据此构建了52份核心种质的SSR分子指纹图谱、分子身份证条形码和二维码。[结论]江西杉木种质资源的遗传多样性较丰富，构建的江西52份杉木核心种质具有代表性，选择上诉4个高效SSR标记可有效鉴别核心种质，并成功绘制了江西杉木核心种质的分子身份证。