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药物分子与其受体的快速对接方法研究
药物分子与其受体的快速对接方法研究
作者:
迟翰林
陈健全
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
药物设计
分子对接
遗传算法
模拟退火算法
退火进化算法
摘要:
分子的快速对接方法是理性药物筛选的研究热点之一. AEDock是在AutoDock2.4基础上开发的分子对接软件. 为改善构象搜索功能,而采用退火进化算法代替AutoDock2.4软件中的模拟退火算法(simulated annealing algorithm, SA),因为退火进化算法(annealing evolution algorithm, AEA)综合了模拟退火算法和遗传算法(genetic algorithm, GA)的优点. 已证明AutoDock2.4可预测多达8个旋转键的柔性配体与刚性大分子的结合构象. 采用体积较大的HIV-1蛋白酶抑制剂XK263分子和其他常用分子的测试结果表明,AEDock可成功预测多达10个旋转键的柔性配体与刚性大分子的结合构象. 此外,搜索所需的结合态与SA算法相比要少,成功率却高.
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文献信息
篇名
药物分子与其受体的快速对接方法研究
来源期刊
科学通报
学科
医学
关键词
药物设计
分子对接
遗传算法
模拟退火算法
退火进化算法
年,卷(期)
1999,(11)
所属期刊栏目
简报
研究方向
页码范围
1161-1165
页数
5页
分类号
R9
字数
2781字
语种
中文
DOI
10.3321/j.issn:0023-074X.1999.11.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈健全
中国医学科学院中国协和医科大学药物研究所
1
10
1.0
1.0
2
迟翰林
中国医学科学院中国协和医科大学药物研究所
1
10
1.0
1.0
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研究主题发展历程
节点文献
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遗传算法
模拟退火算法
退火进化算法
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
科学通报
主办单位:
中国科学院国家自然科学基金委员会
出版周期:
旬刊
ISSN:
0023-074X
CN:
11-1784/N
开本:
大16开
出版地:
北京东城区东黄城根北街16号
邮发代号:
80-213
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
11887
总下载数(次)
74
总被引数(次)
204018
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