用理论方法建立memapsin2蛋白酶的三维结构模型

• 作者: 嵇汝运 曹阳 沈竞康 罗小民 蒋华良 薛红 陈凯先 黄小琴
• 来源期刊: 中国药理学报（英文版）
• 学科: 医学
• 关键词: 阿尔茨海默病 淀粉样β-蛋白 模板 药物设计
• 年，卷（期）: 2001,（1）
• 所属期刊栏目: 研究原著
• 页码范围: 50-56
• 页数: 7页
• 分类号: R96
• 语种: 英文

摘要

目的：通过理论方法建立M2蛋白酶的三维结构模型.方法：基于模板进行多重序列联配和结构联配建立M2蛋白酶的初始结构模型，对初始模型进行分子力学和分子动力学优化，用多种评价方法对所得结构进行合理评价.结果：得到了M2蛋白酶的三维结构模型，合理性评价结果表明该结构模型正确，M2蛋白酶的催化活性位点与天冬氨酸蛋白酶相似，区别在于与活性位点相邻的结构域的构象不同.结构保守区α碳原子叠合结果说明M2蛋白酶与其他天冬氨酸蛋白酶具有相同的生物进化来源.结论：M2蛋白酶的结构模型可以为进一步的分子生物学实验提供有益的参考，也可以此模型为基础进行数据库筛选和药物分子设计.