汉坦病毒HTN261株S基因片段的核苷酸序列测定及分析

• 作者: 刘彦成 刘忠伟 吴玉华 孔宪刚 孙成群 孙蓉芳 崔岩 张宝山 张秀彬 李冀宏 甄尚敏 许君 陈露菲
• 来源期刊: 中国病毒学
• 学科: 医学
• 关键词: 汉坦病毒 分子克隆 聚合酶链反应 碱基序列
• 年，卷（期）: 2001,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 140-145
• 页数: 6页
• 分类号: Q786|R373
• 字数: 3137字
• 语种: 英文

摘要

黑龙江省是肾综合征出血热(HFRS)的重疫区。近年来HFRS年的发病人数曾超过万人。流行病学和血清学研究表明黑龙江省HFRS疫区主要是姬鼠型，但目前尚缺乏病毒的分子生物学资料。我们对从疫区捕获的宿主动物-黑线姬鼠肺中分离的汉坦病毒HTN261株的S基因片段的全基因序列进行了测定和初步分析。结果如下，HTN261株的S基因片段的全序列长为1697nt。只有一个主要的编码N蛋白的ORF，起始位置为第37nt，终止于1326nt，编码的蛋白长为429aa。没有发现存在ORF2。HTN261株的S基因片段核苷酸序列与HTN型中的病毒株的同源性很高，而与汉坦病毒其他型的同源性较差。从种系发生树分析来看，HTN261株归结于汉坦病毒的HTN型。在HTN型之内，HTN261株和HTN76-118株在一个分枝内。就其核苷酸和蛋白的同源性来说，HTN261株和HTN76-118株的同源性分别是89%(全S基因)和98%(蛋白)。而与中国境内发现的其他汉坦病毒株Z10，HU，Chen4，NC167等基因和蛋白的同源性相对较差。汉坦病毒除具有其宿主的依赖性外，还具有其地理的簇集性。HTN261株和HTN76-118株之间S基因和N蛋白序列的变异性的差异分别为11%和2%，表明HTN261株和HTN76-118株还有不同，可能是不同的亚型。不过，尚有待于进一步研究证明。