汉坦病毒湖北株M片段G1编码区基因变异研究

• 作者: 侯炜 刘东瀛 刘建军 文利 杨占秋 王卫华 肖红 陈晓湘
• 来源期刊: 武汉大学学报(医学版)
• 学科: 医学
• 关键词: 汉坦病毒 聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 序列分析,DNA
• 年，卷（期）: 2001,（4）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 289-292
• 页数: 5页
• 分类号: R373.3
• 字数: 3662字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8852.2001.04.001

摘要

目的:探讨近年来汉坦病毒HTN湖北株 M基因片段G1编码区部分基因序列的变异情况. 方法:根据汉坦HTNM片段G1编码区核苷酸序列设计引物,利用RT-PCR方法对75份病程在7 d 以内的肾综合症出血热(HFRS)患者(经临床诊断和ELISA确诊)血清标本进行检测,并对扩增出的目的基因片段选用3种限制性内切酶AluⅠ、 RsaⅠ、 MboⅠ进行酶切,根据限制性片段长度多态性分析筛选出变异毒株,继而通过序列测定,得到变异毒株G1编码区部分核苷酸序列,并与标准株HTN76-118及地方株HTN 114的相应核苷酸序列及氨基酸序列进行比较分析.结果:75份血清标本通过RT-PCR方法进行检测,阳性率为77.3%.扩增片段用3种限制性内切酶AluⅠ、 RsaⅠ、 MboⅠ进行酶切分析,发现4份阳性产物其限制性片段长度多态性与HTN 76-118均不相同,但其中3份阳性产物限制性片段长度多态性与地方株HTN 114基本相同,1份与HTN 114株不完全相同.对该扩增产物的核苷酸序列和氨基酸序列进行同源性分析表明,其核苷酸序列与标准株76-118的同源性为83.3%,与地方株HTN 114的同源性为96%;推导氨基酸序列与HTN 76-118的同源性为93.2%,与地方株HTN 114的同源性为99%.结论:①近年来引起湖北地区HFRS的主要毒株仍为HTN地方株.②从分析的病例样品来看,湖北地区HTN基因较为稳定,与14年前相比未发生明显改变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨占秋	武汉大学医学院病毒学研究所	101	1178	18.0	29.0
2	刘建军	武汉大学医学院病毒学研究所	22	245	8.0	15.0
3	侯炜	武汉大学医学院病毒学研究所	49	258	8.0	14.0
4	肖红	武汉大学医学院病毒学研究所	31	634	13.0	24.0
5	文利	武汉大学医学院病毒学研究所	11	114	5.0	10.0
6	刘东瀛	武汉大学医学院病毒学研究所	13	64	5.0	7.0
7	王卫华	武汉大学医学院病毒学研究所	3	66	2.0	3.0
8	陈晓湘	武汉大学医学院病毒学研究所	3	66	2.0	3.0