口蹄疫病毒株China/99L区段核苷酸序列测定及比较分析

• 作者: 刘在新 刘相涛 常惠芸 张显升 李冬 江鹏斐 谢庆阁 赵启祖 陈应理 魏怀录
• 来源期刊: 中国病毒学
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 L基因 序列比较分析
• 年，卷（期）: 2002,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 158-162
• 页数: 5页
• 分类号: S855.3|Q343.1
• 字数: 940字
• 语种: 英文

摘要

以口蹄疫病毒株China/99 RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy载体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用电泳、PCR ampos和EcoR1酶切法鉴定.该毒株与A10、O\-1K、O1C ampos和TW45毒株的核苷酸序列差异率分别为15.27%、15.56%、15.56%和15.49%;氨基酸序列差异率分别为8.29%、8.76%、9.22%和10.14%.五个毒株的L/P1连接处均为苷氨酸(Gly)/异亮氨酸(Ile).序列比较表明,T-C、A-G和A-C转换率较高,是点突变的热点核苷酸,是影响氨基酸稳定的因素之一.第43-53、95-105、108-111、146-153、161-173、183-188和182-187区域极有可能是L蛋白酶的活性中心,第48位的H、51的C、65位的E、95位的H、109位的H、138位的H、148位的H和165位的E可能是L蛋白酶的活性位点,它们在维持蛋白质的空间构像和功能方面具有重要作用.