新型抗菌多肽LC1的1H-NMR谱峰归属和二级结构分析

• 作者: 卢光莹 宫维斌 徐庆 朱家鹏 王金凤 程源 邵承华 陈章良
• 来源期刊: 生物化学与生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 抗菌多肽 二维核磁共振 序列专一归属 二级结构
• 年，卷（期）: 2002,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 457-462
• 页数: 6页
• 分类号: Q5
• 语种: 英文

摘要

LC1 是从枯草杆菌A014的分泌物中分离出的一种新型抗菌多肽, 具有很强的抗水稻白叶枯致病菌的能力. 应用2D-NMR技术研究LC1的溶液构象, 通过分析其在水和重水中的DQF-COSY、 TOCSY和NOESY等1H-NMR谱, 识别了LC1全部47个氨基酸残基的自旋体系, 并通过分析NOESY谱中dαN、 dNN、 dβN和dαδ的联系完成了序列专一谱峰归属, 标定了全部主链质子和绝大部分侧链质子的化学位移. 谱峰归属结果和NMR数据分析表明LC1的二级结构主要为伸展构象, 其中肽段Phe25～Asp31和Tyr36～Glu42构成反平行β折叠, 并由Ser32～Gly35所形成的β转角相连接. LC1不含或仅含少量α螺旋. 同时, 通过对LC1的大量疏水氨基酸残基之间NOE联系的分析, 推测LC1具有一个以Trp23为中心的疏水核心.