16S～23S rDNA间区在链球菌和流感嗜血杆菌分类中的应用

• 作者: 杨宏欣 杨持 鲁辛辛
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 16S～23Sr RNA间区 链球菌 流感嗜血杆菌 分类
• 年，卷（期）: 2003,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 189-194
• 页数: 6页
• 分类号: Q523
• 字数: 2684字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2003.02.017

摘要

利用16S～23S rDNA间区(intergenic spacer regions,ISR)在不同细菌中拷贝数、碱基排列、序列长度及所含tRNA基因种类和数目的差异,对15株链球菌和流感嗜血杆菌进行属、种、型和株系的分类鉴定.在16S rDNA的3′端和23S rDNA的5′端的保守区中合成引物,PCR扩增16S～23S rDNA ISR序列,对多态片段切胶纯化直接测序.在GenBank上查找对应细菌的ISR序列.用DNAMAN软件进行系统进化分析.链球菌属为单拷贝16S～23Sr RNA ISR、有一个tRNAAla基因编码区、分子大小在269～446bp之间,序列分成4个保守区和4个可变区,可变区碱基排列方式和数目的不同是种分类的依据.7株链球菌的同源率在78%～88%.同种异株的差异反映在碱基的插入和缺失上.流感嗜血杆菌各生物型均为2个拷贝的ISR,小片段为514～519bp,编码1个tRNAGlu基因,有3个狭窄可变区.大片段富含A T碱基,在I、II和IV型中分别是868、848和856bp,编码一个tRNAIle基因和一个tRNAAla基因.不同生物型小分子ISR与标准菌株比较,同源性在97.3%～99.6 %之间. ISR作为细菌分类的目的基因具有属、种、型和株特异性与灵敏性.简单的基因分离分析技术为认识病原微生物提供了更多的机会.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨持	内蒙古大学生命科学院	107	2794	32.0	46.0
2	鲁辛辛	内蒙古大学生命科学院	3	60	3.0	3.0
6	杨宏欣		1	11	1.0	1.0